Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-2B6SEH9 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-2B6SEH9 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.5 ms