Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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