Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SMG9Q9H0W8 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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