Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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