Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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