Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PDK4Q16654 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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