Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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