Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms