Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms