Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms