Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ALCAMQ13740 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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