Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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CUL4BQ13620 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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CUL4BQ13620 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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CUL4BQ13620 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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CUL4BQ13620 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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CUL4BQ13620 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4BQ13620 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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