Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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