Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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