Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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