Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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CHAF1BQ13112 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CHAF1BQ13112 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
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