Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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FOXD4Q12950 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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