Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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