Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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