Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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