Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms