Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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