Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTXN3Q4LDR2 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms