Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BBS9Q3SYG4 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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