Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PDK4Q16654 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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PDK4Q16654 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PDK4Q16654 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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