Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USF2Q15853 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
USF2Q15853 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USF2Q15853 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USF2Q15853 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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