Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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