Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms