Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms