Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms