Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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