Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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