Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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