Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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HOXD13P35453 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD13P35453 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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