Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 KCNJ15-205ENST00000398930 2914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GSG1-203ENST00000396302 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms