Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GDAP2Q9NXN4 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms