Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms