Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms