Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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SS18Q15532 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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SS18Q15532 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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SS18Q15532 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SS18Q15532 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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