Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms