Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CHD4Q14839 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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