Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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