Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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