Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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TCOF1Q13428 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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