Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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