Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC068044.1-201ENST00000441585 1978 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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