Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.4 ms