Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms