Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTPAP49638 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms