Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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CASQ1P31415 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CASQ1P31415 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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